Faktor-faktor yang mempengaruhi perubahan frekuensi alel suatu populasi adalah sebagai berikut:
Rekombinasi Genetik Rekombinasi adalah proses pembentukan kombinasi alel baru. Rekombinasi genetik terjadi selama reproduksi seksual pada saat pembentukan gamet. Terjadi pertukaran materi genetik antara kromatid non-saudara selama meiosis yang disebut pindah silang. Ini mengarah pada rekombinasi dan merupakan salah satu penyebab variabilitas genetik dalam suatu populasi.
Mutasi Mutasi adalah perubahan mendadak yang diwariskan yang terjadi pada gen dan memiliki efek fenotipik tertentu. Mutasi kromosom mungkin disebabkan oleh perubahan gen atau struktur atau jumlah kromosom, misalnya karena perubahan gen. penghapusan, inversi, duplikasi, translokasi, aneuploidi, poliploidi, dll. Mutasi menghasilkan berbagai perubahan yang mungkin berbahaya. Banyak dari bentuk gen mutan bersifat resesif dan hanya diekspresikan dalam kondisi homozigot. Mutasi yang menguntungkan dapat dipilih melalui seleksi alam dan perubahan kecil secara bertahap terakumulasi seiring berjalannya waktu. Mutasi ini menyebabkan variasi dalam suatu populasi. Perubahan mendadak dalam kimia gen (DNA) telah terjadi kemampuan untuk mengubah efek fenotipiknya. Setiap perubahan di nukleotida gen (DNA) mempunyai kemampuan untuk mengubah fenotipiknya memengaruhi. Setiap perubahan dalam urutan nukleotida DNA atau jika ada sepasang nukleotida tergantikan akan timbul mutasi. Ini disebut sebagai titik mutasi atau mutasi gen. Hal ini terjadi secara spontan di alam. Mutasi mungkin disebabkan oleh induksi, gas mustard, sinar X, sinar gamma, sengatan listrik, sengatan suhu dll. Mutasi ini jarang terjadi. Itu terjadi secara tiba-tiba dan dapat diwariskan. Mutasi dapat menghasilkan perubahan drastis dan mungkin merugikan, berbahaya, mematikan, atau mungkin tidak signifikan. Di sana mempunyai peluang yang sama bagi suatu gen untuk bermutasi kembali normal. Sebagian besar gen mutan bersifat resesif terhadap gen normal dan mampu berekspresi secara fenotip hanya pada keadaan homozigot. Jadi mutasi gen sudah terjadi kemampuan untuk menghasilkan variasi keturunan yang dapat diwariskan. Di dalam pasangan gen heterozigot antar populasi kecil akan cenderung menjadi homozigot. Karena itu, karakter yang dirugikan mungkin ada dinyatakan dan organisme tersebut akan disingkirkan. Pergeseran genetik seperti itu tidak teoretis. Mereka beroperasi pada populasi kecil di Kepulauan. Ini penyimpangan genetik memberikan cara untuk menentukan garis evolusi.
Penyimpangan Genetik dan Aliran Gen Setiap perubahan frekuensi gen/alel suatu populasi karena perubahan yang tiba-tiba dan acak disebut penyimpangan genetik. Hal ini terjadi karena peristiwa kebetulan. Pergeseran genetik lebih menonjol pada populasi kecil. Aliran gen disebabkan oleh imigrasi atau emigrasi individu dari satu populasi ke populasi lainnya. Jika migrasi terjadi berkali-kali maka akan menyebabkan aliran gen dan mengubah frekuensi alel/gen populasi.
Seleksi alam Organisme yang lebih mampu beradaptasi terhadap lingkungan dipilih oleh alam. Seleksi alam menghasilkan perubahan frekuensi gen dari satu generasi ke generasi lainnya yang mendukung bentuk reproduksi diferensial.
Isolasi Ini adalah salah satu faktor penting yang bertanggung jawab atas teori evolusi sintetik. Isolasi membantu mencegah perkawinan silang organisme terkait yang merupakan bentuk isolasi reproduksi.
Selain faktor-faktor tersebut, faktor lain seperti hibridisasi antara dua spesies meningkatkan variabilitas genetik suatu populasi.
